Naudojimuisi tarpininkavimu neretai įtakos gali turėti išlaidos. Suprantama, kad kai kuriose valstybėse narėse siūlomas nemokamas tarpininkavimas galimybę pasinaudoti šiuo procesu palengvina. Taip yra ir tuomet, kai tarpininkavimo išlaidas gali padengti teisinės pagalbos sistema.
Tačiau kai iš šalių imamas mokestis pradedant pačiu pirmuoju informaciniu susitikimu dėl tarpininkavimo, itin svarbu, kad tarpininkavimo išlaidos būtų skaidrios. Praktiškai šį skaidrumą galima užtikrinti įstatymu (arba teisėjui) preliminariai nustatant tarpininkų mokesčius ir (arba) įtraukiant juos į tarpininkavimo sutartį, tarpininko ir šalių sudaromą prieš pradedant procesą. Be to, šalys turi turėti galimybę susipažinti su mokesčių sąrašais.
Daugiau informacijos apie tarpininkavimo išlaidas valstybėse narėse galima rasti puslapyje Tarpininkavimas valstybėse narėse.