Úlohou EJS (pre trestné veci) je zjednodušiť justičnú spoluprácu v trestných veciach poskytovaním právneho poradenstva a praktických rád a pomáhať pri vytváraní priamych kontaktov medzi príslušnými národnými orgánmi. Kontaktné osoby EJS (pre trestné veci) sa takisto podieľajú na organizácii a propagácii školení o justičnej spolupráci v trestných veciach.
Na webovej stránke EJS (pre trestné veci) sú k dispozícii elektronické nástroje na zjednodušenie spolupráce, ako aj ďalšie praktické informácie vrátane informácií o spolupráci s krajinami a justičnými sieťami mimo EÚ.
EJS (pre trestné veci) spravuje sekretariát, ktorý sídli v priestoroch Eurojustu v Haagu. Súčasným vedúcim sekretariátu EJS (pre trestné veci) je pán Ola Löfgren.